O'u cymharu â dulliau diheintio traddodiadol, mae chwistrellwyr nano yn cynnig y manteision canlynol:
Cyflym ac effeithlon: Yn ystod y llawdriniaeth, mae'r ffroenell yn atomizes y diheintydd yn ronynnau bach, gan gynyddu arwynebedd yr hylif ac effeithlonrwydd chwistrellu, a thrwy hynny gyflawni diheintio trylwyr yn gyflymach.
Arbedion diheintydd: Trwy ddefnyddio nanotechnoleg i atomeiddio'r diheintydd yn ronynnau microsgopig, mae chwistrellwyr nano yn lleihau faint o ddiheintydd sydd ei angen, a thrwy hynny leihau costau diheintio.
Yn fwy diogel ac yn fwy ecogyfeillgar: Yn wahanol i ddulliau traddodiadol sy'n dibynnu ar ddiheintyddion cemegol niweidiol, nid yw'r atebion a ddefnyddir mewn chwistrellwyr nano yn wenwynig ac yn ddiniwed, ac nid ydynt yn peri unrhyw risg o anaf i ddefnyddwyr na'r rhai gerllaw.

